داستان بازی در دهه‌ی 60 میلادی اتفاق می‌افتد. شخصیت اصلی داستان یعنی Alex Mason یکی از افراد باتجربه CIA است؛ که در ابتدای بازی و در حین مأموریت دستگیرشده و به یکی از زندان‌های روسیه منتقل می‌شود،